Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Afg3l1Q920A7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Afg3l1Q920A7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Afg3l1Q920A7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms