Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZA3

Pcca, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccaQ91ZA3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PccaQ91ZA3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PccaQ91ZA3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms