Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atpaf2Q91YY4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atpaf2Q91YY4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atpaf2Q91YY4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms