Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdhb12Q91Y07 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb12Q91Y07 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms