Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Basp1Q91XV3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Basp1Q91XV3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms