Protein–RNA interactions for Protein: Q91XB0

Trex1, Three-prime repair exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex1Q91XB0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trex1Q91XB0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trex1Q91XB0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trex1Q91XB0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trex1Q91XB0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trex1Q91XB0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trex1Q91XB0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trex1Q91XB0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trex1Q91XB0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trex1Q91XB0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trex1Q91XB0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms