Protein–RNA interactions for Protein: Q91WM3

Rrp9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp9Q91WM3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rrp9Q91WM3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rrp9Q91WM3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rrp9Q91WM3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms