Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trub2Q91WG3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trub2Q91WG3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trub2Q91WG3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms