Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Setd3Q91WC0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Setd3Q91WC0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms