Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csde1Q91W50 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Csde1Q91W50 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csde1Q91W50 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms