Protein–RNA interactions for Protein: Q91VK4

Itm2c, Integral membrane protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2cQ91VK4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itm2cQ91VK4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itm2cQ91VK4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itm2cQ91VK4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms