Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NifkQ91VE6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NifkQ91VE6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NifkQ91VE6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NifkQ91VE6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NifkQ91VE6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NifkQ91VE6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NifkQ91VE6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms