Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cacng5Q8VHW4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacng5Q8VHW4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms