Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crb1Q8VHS2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crb1Q8VHS2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crb1Q8VHS2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Crb1Q8VHS2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Crb1Q8VHS2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Crb1Q8VHS2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms