Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SelenomQ8VHC3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SelenomQ8VHC3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SelenomQ8VHC3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SelenomQ8VHC3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SelenomQ8VHC3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SelenomQ8VHC3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SelenomQ8VHC3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SelenomQ8VHC3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms