Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE0

Rpe, Ribulose-phosphate 3-epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpeQ8VEE0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RpeQ8VEE0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RpeQ8VEE0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms