Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc115Q8VE99 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc115Q8VE99 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms