Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sgip1Q8VD37 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sgip1Q8VD37 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sgip1Q8VD37 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms