Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc18Q8VD24 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc18Q8VD24 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms