Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8VCE4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8VCE4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8VCE4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q8VCE4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8VCE4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8VCE4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms