Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RttnQ8R4Y8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RttnQ8R4Y8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RttnQ8R4Y8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RttnQ8R4Y8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RttnQ8R4Y8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RttnQ8R4Y8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RttnQ8R4Y8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RttnQ8R4Y8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RttnQ8R4Y8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RttnQ8R4Y8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RttnQ8R4Y8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms