Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Top1mtQ8R4U6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Top1mtQ8R4U6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
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