Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nup35Q8R4R6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nup35Q8R4R6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms