Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r200Q8R281 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Vmn1r200Q8R281 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Vmn1r200Q8R281 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Vmn1r200Q8R281 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Vmn1r200Q8R281 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Vmn1r200Q8R281 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Vmn1r200Q8R281 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r200Q8R281 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Vmn1r200Q8R281 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r200Q8R281 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Vmn1r200Q8R281 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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