Protein–RNA interactions for Protein: Q8R259

Vmn1r202, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r202Q8R259 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r202Q8R259 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r202Q8R259 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms