Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sf3b4Q8QZY9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3b4Q8QZY9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms