Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rnf183Q8QZS5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rnf183Q8QZS5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rnf183Q8QZS5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf183Q8QZS5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf183Q8QZS5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rnf183Q8QZS5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf183Q8QZS5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf183Q8QZS5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf183Q8QZS5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rnf183Q8QZS5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rnf183Q8QZS5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf183Q8QZS5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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