Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Z9

Pom121, Nuclear envelope pore membrane protein POM 121, mousemouse

Predictions only

Length 1,200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pom121Q8K3Z9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pom121Q8K3Z9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pom121Q8K3Z9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pom121Q8K3Z9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pom121Q8K3Z9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pom121Q8K3Z9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pom121Q8K3Z9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms