Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Cdk5rap2Q8K389 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdk5rap2Q8K389 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk5rap2Q8K389 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms