Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nsl1Q8K305 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nsl1Q8K305 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nsl1Q8K305 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms