Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf39Q8K2Z2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf39Q8K2Z2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf39Q8K2Z2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf39Q8K2Z2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf39Q8K2Z2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf39Q8K2Z2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf39Q8K2Z2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf39Q8K2Z2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf39Q8K2Z2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf39Q8K2Z2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf39Q8K2Z2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prpf39Q8K2Z2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prpf39Q8K2Z2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prpf39Q8K2Z2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms