Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccm2Q8K2Y9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccm2Q8K2Y9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms