Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf13Q8K2W6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf13Q8K2W6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms