Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Paf1Q8K2T8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Paf1Q8K2T8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Paf1Q8K2T8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms