Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc12Q8K2L8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trappc12Q8K2L8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc12Q8K2L8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms