Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Colgalt1Q8K297 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Colgalt1Q8K297 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Colgalt1Q8K297 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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