Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Abcf3Q8K268 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Abcf3Q8K268 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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