Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trim68Q8K243 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim68Q8K243 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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