Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sde2Q8K1J5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sde2Q8K1J5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sde2Q8K1J5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sde2Q8K1J5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms