Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rasgef1bQ8JZL7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rasgef1bQ8JZL7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms