Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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Znf628Q8CJ78 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Znf628Q8CJ78 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Znf628Q8CJ78 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Znf628Q8CJ78 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Znf628Q8CJ78 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Znf628Q8CJ78 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Znf628Q8CJ78 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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