Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SbsnQ8CIT9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SbsnQ8CIT9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.3 ms