Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CopaQ8CIE6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopaQ8CIE6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopaQ8CIE6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms