Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nupl2Q8CIC2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nupl2Q8CIC2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms