Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11fip3Q8CHD8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rab11fip3Q8CHD8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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