Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Upp2Q8CGR7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Upp2Q8CGR7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms