Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rbm28Q8CGC6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rbm28Q8CGC6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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