Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdc34Q8CFI2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cdc34Q8CFI2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cdc34Q8CFI2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdc34Q8CFI2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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