Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF25

UPF0575 protein C19orf67 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CF25 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8CF25 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CF25 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CF25 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CF25 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CF25 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CF25 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CF25 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CF25 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CF25 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CF25 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CF25 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CF25 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CF25 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CF25 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8CF25 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8CF25 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8CF25 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8CF25 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CF25 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CF25 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CF25 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CF25 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CF25 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CF25 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CF25 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8CF25 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CF25 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CF25 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CF25 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CF25 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CF25 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CF25 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CF25 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CF25 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CF25 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8CF25 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms