Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms